Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms