Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apol7aB2RT54 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms