Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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