Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H60cB1B213 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms