Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
H2al1jA2BFR3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms