Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms