Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms