Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm3550W4VSN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms