Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nme3Q9WV85 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms