Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ercc4Q9QZD4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms