Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chaf1aQ9QWF0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms