Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dkk3Q9QUN9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms