Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms