Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms