Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod3Q9JHJ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms