Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timp4Q9JHB3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timp4Q9JHB3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms