Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rb1cc1Q9ESK9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms