Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc4Q9ES56 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms