Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tfcp2Q9ERA0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms