Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Tpcn1Q9EQJ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpcn1Q9EQJ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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