Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r29Q9EQ41 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r29Q9EQ41 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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