Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tsc1Q9EP53 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms