Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
3110070M22RikQ9DAQ7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms