Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgf29Q9DA08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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