Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms