Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capns2Q9D7J7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capns2Q9D7J7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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