Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Borcs6Q9D6W8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms