Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3404Q9D506 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3404Q9D506 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3404Q9D506 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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