Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gcc1Q9D4H2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms