Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rufy3Q9D394 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms