Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Sgo1Q9CXH7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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