Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tdrd12Q9CWU0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd12Q9CWU0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd12Q9CWU0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tdrd12Q9CWU0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tdrd12Q9CWU0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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