Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp5f1Q9CQQ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms