Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nicn1Q9CQM0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms