Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Higd2aQ9CQJ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd2aQ9CQJ1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms