Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnaseh2cQ9CQ18 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms