Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg3Q9CPX6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms