Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms