Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Ddb2Q99J79 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ddb2Q99J79 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ddb2Q99J79 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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