Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc30a1Q99J38 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms