Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip1Q922J3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms