Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klc3Q91W40 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms