Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssx2ipQ8VC66 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms