Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup58Q8R332 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms