Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hecw1Q8K4P8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hecw1Q8K4P8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms