Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brd3Q8K2F0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms