Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trip10Q8CJ53 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms