Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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LgsnQ8CIX8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms