Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms