Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Csnka2ipQ8CH19 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnka2ipQ8CH19 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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